物理性保密措施是保守商业秘密的物理性隔离措施，是保护商业秘密的最基本措施，不仅有实践作用，而且有法律意义。对一个蓄谋要窃取保密文件、进入保密区域的人来说，物理措施也许最终未能防范，但是任何物理措施对法官判案来说，都是非常重要的证据，其是权利人显而易见的、不言自明的保密措施。商业秘密的物理性保护措施的制定和贯彻，应该掌握两个基本原则。第一个原则是全生命期的管理，指对商业秘密的产生、持续、变化、销毁整个生命期，均采取必要的物理保护措施。第二个原则是全方位的管理。对商业秘密的载体，在产生、使用、保存、转移、处置各个环节，均采取有效的物理保护措施。物理性保护措施包括：

　　(1)厂区或生产区域的保密措施。如职工、参观者、运货车出入厂区有固定出入口，厂门设有门卫或有大门自动锁闭装置;厂内可设立特别的保密区，与其他区域有围墙分隔，或以独立的房间设立保密区;建立护厂员站岗或巡逻制度，建立电子监视系统、防盗系统。

　　(2)生产设备、过程的保密措施。含有商业秘密的生产过程可在保密区域内进行;机器设备可用屏风隔离，或在操作间窗户上加装隔板，以阻断外来视线;机器的保密部分可用箱体锁闭;保密的工作程序可简化成使用若干电子按钮，在外部进行操作。

　　(3)对原材料、模具的管理。如果原材料是秘密的，原材料供应可采用密闭容器，不加成分标记，或以颜色、符号代表;如果模具是秘密的，应该专门保管，记录使用时间和使用人，用毕及时归还。

　　(4)对文件的管理。企业可以根据自己的实际情况，划分有关商业秘密的密级，如绝密、机密、秘密等;企业可在保密文件上加盖涉密章或保密声明;确定保密期限，期限的长短应根据商业秘密有用性的长短而定;商业秘密事项变更，或者密级变更后，应及时在文件资料或其他物品上标明，并通知有关人员。

　　要建立保密文件管理的责任制，全面规范文件的拟稿、复制、打印、收发、承办、借阅、保管、清退、移交、归档、销毁等过程。

　　(5)计算机的保密措施。涉密计算机与非涉密计算机网络要 实行物理隔离，做到上网信息不涉密，涉密信息不上网。

　　非涉密计算机可粘贴编号，与之相连的打印机等设备禁止处理涉密信息。

　　应使用电磁泄漏防护装置，配置防火墙、安全路由器、保密网关等。

　　要拆除软盘、USB接口及光盘刻录，或限制移动存储设备复制接口;使用指纹、密码加密移动硬盘、U盘等具有加密保护功能的移动存储设备;携带涉密移动存储介质外出，须经单位领导批准;防止将私人U盘、数码相机、MP3播放器、移动电话等接入涉密计算机。

　　要采用身份鉴别技术，包括设置电脑登录密码，口令验证，设置文件使用密码，对数据进行加密。

　　访问权限控制，安装电脑操作历史记录软件，进行网络监控与侦察，管理谁在什么时间、访问什么内容，对可疑行为实时监控。

　　涉密人员离岗前，要全部清退涉密移动存储工具。

　　涉密计算机系统维修要有专人监督。

　　(6)对废弃物的管理。对所有办公垃圾根本不分类，一律将载体彻底破坏，如使用碎纸机等将纸件垃圾包括各种图纸、数据、中间记录、文件、废弃的磁盘、复写纸、复印纸、打字蜡纸、打字机色带等，彻底粉碎。