大多数软件著作权案件都离不开软件著作权鉴定，但对软件著作权鉴定的认识存在误解，在司法实践中应当尽可能避免这些问题的出现，避免因这些问题导致鉴定意见不被采信。
 

　　1、软件著作权鉴定是不是一定是对源程序进行鉴定?

　　除了目标程序外，源程序是不会带外公开的，软件的功能主要是通过源程序来实现，源代码是软件的核心部分，公开源代码无疑就是公开自己的核心竞争力，让竞争对手有了利用的可能，源程序是通过转化为目标程序后，以目标程序的形式向外传播。
 

　　2、比对的代码不完全相同会怎么样?

　　通常情况下，侵权人使用的软件代码与权利人的软件代码不可能完全一致，一方面是因为侵权人明知侵犯他人软件著作权，为规避侵权，或者为降低侵权风险，会对权利人的软件代码进行一定程度和一定范围的修改;另一方面，大部分侵权人会在权利人已有的软件代码基础上，进行部分修改，完全一样的可能性很小;还有种情况是，侵权人使用的软件代码的背景会有一定的变化，或多或少存在不同。
 

　　3、加密、解密是不是软件著作权鉴定的必经程序?

　　在进行软件著作权鉴定时，通常会遇到加密、解密，但加密、解密过程本身不是软件著作权鉴定的对象。软件著作权鉴定的是具体的软件代码，是能够实质性影响软件功能、软件内容的代码，加密只是权利人的保护手段、解密也只是侵权人破秘的手段。加密、解密过程本身不是软件代码对比要涉及的内容，也不是软件著作权鉴定所针对的对象。因此，在进行软件著作权鉴定时，必须清楚加密、解密并不是软件著作权鉴定的必经程序。