中医药企业的商业秘密保护主要包括有关药品研发的内容(试验数据)、不适合申请专利的技术创新(技术创新不属于专利保护的主题如药用动植物品种、中医病症的诊断和治疗方法等;很难被他人“破译”的成果)、企业的营销状况(销售渠道、客户名单)等。面对中医药商业秘密保护存在的诸多问题，我们应研究对中医药商、世秘密的保护对策。
 

　　(一)提高中医药行业的知识产权保护意识

　　加强对中药行业从业人员的知识产权的普遍培训。明确知识产权是一种无形资产和竞争的武器，是对中医药发明创造的保护，对中医药的研究、开发、生产部门的从业人员普遍进行商业秘密保护的宣传、教育，提高今行业的知识产权保护意识和商业秘密保护意识，还要使其能够从企事业单位科学研究、经营策略和发展战略的高度上重视和看待中医药商业秘密保护问题，从而进一步科学地使用商业秘密以保护本企业的合法利益。
 

　　(二)强化中医药企业商业秘密管理制度

　　目前，企业商业秘密的主要涉及企业档案和人事管理两方面。首先，要制定企业保密规划，订立商业秘密的保密范围以及企业内部对文件、资料、数据、配方的管理办法和制度。其次，要防范人为因素造成的商业秘密损失，如与员工签订有关商业秘密的保密协议，以合同的方式明确约定企业和员T关于保护商业秘密的权利和义务，要求员T保守和不得向外透漏企业的商业秘密。实践中中医药企业的商业秘密之所以流失严重，主要是通过人员跳槽流失的。目前许多企业采取雇主与雇员签订竞业禁止协议的办法，是一个较好的选择。
 

　　(三)加强中医药商业秘密保护力度

　　当然，在中医药的开发上，判断可以作为秘密保护的技术内容必须小心谨慎，最好的是多种方式结合，如与专利、商标、版权等方式相结合。最大限度的保护商业秘密。如果技术容易被人破解，申请专利的保护是一种比较好的保护方式，如果该技术极难破解，用商业或技术秘密的方式保护该技术则会更好。因此，利用专利或技术秘密来保护传统中医药知识产权也得动脑筋，讲策略，根据技术本身的特性进行选择，最大限度的保护中医药商业秘密。