商业秘密的司法鉴定，是指侵犯商业秘密刑事案件中，控方或辩方委托相关的鉴定机构，对某项信息中的专门性问题作出鉴别和判断，以确定该项信息是否具备商业秘密的某些构成要件，以及当事人的信息是否相同或者等同。不同于普通犯罪案件，侵犯商业秘密刑事案件具有法律问题与技术问题高度融合的重要特征，两者密不可分、互相关联。具体言之，技术问题的解决，是查明案件事实的重要组成部分，是解决侵犯商业秘密案件中法律问题的铺垫和前提。只有技术问题解决了，才有可能正确地解决法律问题，才能对案件有一个正确的理解和把握，才能正确地定性和量刑。司法实务人员往往只是对于商业秘密中的法律问题比较了解或精通，而对于商业秘密中的技术问题却无能为力。商业秘密在各行各业都存在，而且每个行业的特点和知识背景都不一样，同时，商业秘密大多涉及行业中的尖端或者前沿性的专业知识，办案人员不可能仅凭自身知识就做出是否构成犯罪、产生侵权的判断，所以，对于侵犯商业秘密案件中技术问题的解决，只能求助于司法鉴定。从司法实践来看，侵犯商业秘密公诉案件现在已经形成一个基本的模式：先是接到举报抓获犯罪嫌疑人，之后作商业秘密的相关鉴定，然后法官依据鉴定结论判断行为人是否构成侵犯商业秘密罪，并依据所造成的损失额进行定罪量刑，可见，商业秘密的司法鉴定目前在刑事诉讼程序中成了必不可少的一环，是一个非常重要的问题。但是，由于立法的缺失和司法的混乱，商业秘密的司法鉴定存在很多模糊不清之处，是司法实务界所普遍面临的一个司法难题。